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污泥内部:专家如何进行COVID废水测试

混乱但必要的

分享这个故事 图片来源:KC Water公司的首席工厂操作员凯文·赫尔曼(Kevin Herman)参观了“污泥屋”和筛选废物的机器。(Vicky Diaz-Camacho | Flatland)

坐落在堪萨斯城霍桑路沿线的铁路后面,蓝河污水处理厂看起来并不怎么样。

但在室内,墙上的电视屏幕正在追踪水流,定位废物并筛选它们。

在一个大棚子里,巨大的机器在筛选“污泥”,这是固体废物的委婉说法。在后面开两分钟的车就到了所谓的“泥屋”。

“从美景镇到这里,我们什么都有,”KC水务公司的首席工厂操作员凯文·赫尔曼(Kevin Herman)说。“五千万到六千万加仑。”

水流通过运河流入设施,然后通过地下管道。工作人员打开了一个看起来像迷你塑料棚的东西。然后,液体进入一个更大的容器中,操作员在那里提取样本。

每周二,大约四分之一杯的废水被吸进小塑料容器,用手倒。盖上时间和日期后,卫生部门会把瓶子运到实验室。

“没什么,”斯科特·戈因斯(Scott Goins)说,他是那天早上收集样本的工厂高级操作员。


步骤:与Scott Goins一起收集COVID-19样本


复杂的问题,令人困惑的叙述

虽然这一过程看起来很简单,但一开始跟踪COVID很复杂。

数据收集的方式让公众感到困惑,他们表示不确定如何处理不一致的信息。疾病控制和预防中心承认自己的错误8月。

皮尤研究中心对公共卫生官员的COVID-19应对措施给出了褒贬不一的评价。

疾控中心主任罗谢尔·瓦伦斯基在给媒体的一份声明中说:“我们的表现没有可靠地达到预期。”

如果信息不完整或解释不正确,则风险是标题相互冲突和缺乏公共卫生指导,他写道Raj Dev他是TowardDataScience的特约作者。这种情况发生在2020年和2021年的大部分时间。

在皮尤研究机构的一项调查中,近一半的受访者表示,公共卫生当局“对疫情的准备不足.”

这些观点在各个政治派别都得到了认同,但在共和党人中尤其普遍皮尤.沟通是最大的麻烦。

这些问题是问题的顶点。

科学传播者将此归咎于以下几点:

  • 无法跟踪家庭COVID检测结果。
  • 公共卫生传播工作不力。
  • 缺乏或不清楚进入PCR检测点的途径。
  • 城市领导人在社交场合更宽松的指导方针。

其他原因部分是心理上的。

一些人认为,卫生领导人强调戴口罩或安全社交的指导方针很重要。一些卫生传播的倡导者说,该地区的公共卫生领导人仍然需要有凝聚力和明确的信息。

面向公众的报告,如COVID仪表盘,也可能令人困惑。此外,有些数据是不完整的,因为堪萨斯城都市区的许多县卫生部门停止收集COVID-19人口和病例数据。在更大的范围内,密苏里州于2022年4月初停止在其COVID-19仪表盘上发布一些县的数据。

因此,科学家们试图填补这一空白。

信息是力量

大约两年前,密苏里州卫生和高级服务部(DHSS)、密苏里州自然资源部(DNR)和密苏里大学(MU)之间成立了一个伙伴关系。

他们一起启动了一个项目来填补信息空白。它利用了一个更可靠的工具:公用事业。

当他们意识到用过时的公共卫生报告确定准确的病例率有多么困难时,追踪下水道中的COVID - 19的想法得到了支持。

在大流行爆发的早期,多米诺骨牌就开始倒下。

“我们夜以继日地工作,”密苏里大学哥伦比亚分校(University of Missouri-Columbia)下水道监控项目实验室的首席科学家钟鹤林(Chung Ho-Lin)博士说。“我们有白班和夜班。我们能够在两周内开始开发。”

Chung Ho-Lin博士是密苏里大学哥伦比亚分校下水道监测项目实验室的首席科学家。(密苏里州大学)
Chung Ho-Lin博士是密苏里大学哥伦比亚分校下水道监测项目实验室的首席科学家。(密苏里大学提供)

首席流行病学家杰夫·温泽尔(Jeff Wenzel)和何林(Ho-Lin)一起掌舵。温泽尔和他的团队开始收集废水样本,大学的研究人员可以在实验室中进行研究。

他们专门研究了废水中SARS-CoV-2的病毒载量。这种方法在科学界引起了轰动。它能够更清晰地跟踪大流行。

温泽尔说:“从去年年初、2021年1月、2月开始,我们开始研究变体,看看我们是否能看到一个社区中存在什么变体。”

下水道监测项目小组将跟踪社区传播以及变种是如何传播的。病毒载量越高,病例就越有可能增加。

温泽尔解释说:“当我们看到病毒载量从一周到下一周增加40%或更多时,这就表明我们将看到已知人类病例从至少25%显著增加——有70%的可能性。”

流行病学家通过研究废水来检测人口或疾病发病率的变化,甚至能够检测出新的变异。

当一种被称为B.A.5的欧米克隆亚变种出现时,温泽尔在数据中看到了变化。截至2022年10月,这种子变异占病例总数的62%,随着它的发生,该项目看到了其日益突出的地位。

在过去的两年里,下水道监控项目扩大到密苏里州的100个社区,覆盖了近70%的人口。样本池是理想的,捕捉到更准确的人口普查。

三月的某个时候,CDC的国家废水监测系统(NWSS)概述了早期检测的好处。

“然后可以在废水中检测到病毒,使废水监测能够捕捉到有和没有症状的人传播的SARS-CoV-2的存在。这使得废水监测可以作为COVID-19正在社区传播的早期预警。签署国

废水数据显示的数据是PCR检测没有显示的。它是全面的,与医生在他们的医院看到的现实世界的动态相匹配。

在堪萨斯城,废水监测的好处是显而易见的。

一位城市发言人说,蓝河污水处理厂是该地区最大的污水处理厂,为堪萨斯城近80%的都会区提供污水。


废水的COVID-19趋势

“污水渠监控计划”所追踪的数据截屏。
下水道监测项目跟踪的数据示例,该项目与密苏里州卫生和高级服务部(DHSS)、密苏里州自然资源部(DNR)和密苏里大学(MU)合作。(截图)

流行病学家说,与自我管理的测试相比,废水可以更全面地了解城市中的循环情况。并不是所有的家庭检测都是正确的,也不是所有的结果都被送到卫生部门进行跟踪。这就造成了公共卫生领导人赖以作出下一步决策的关键卫生数据的空白。

污水检测更有效,因为每个人都在地铁地区使用厕所设施。来自那里的样本可以为专家提供更准确的新冠病毒发病率,所有都是实时的。例如,随着每日数据的更新,人们可以查看地图,看看是否有增长,如果需要的话可以推迟旅行,林说。

从人类污泥中得到的数据揭示了一个更清晰的图景。这项工作对温泽尔、林和10名研究人员的团队来说是一次快速而沉重的提升。

但它把科学从实验室带到了现实世界。对林来说,这就是这种合作关系的力量。

尽管他通常躲在一个小办公室里,堆满了文件,一直堆到天花板,但这个项目给了这位密苏里州的科学家一个目标。并不是每天都有一项实验室研究告诉我们现实世界外面发生了什么。

“我能够从零开始见证整个项目。成为一名科学家是非常值得的。”

林笑着说,在日常生活中更多地了解新冠肺炎不应该灌输恐惧,而是让人们生活得更安全、更快乐。他还有最后一条信息。

“高等教育中的科学可以是强大的,”林说。

维姬·迪亚兹-卡马乔在堪萨斯市公共广播公司报道社区事务。

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